變形菌門
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 大腸桿菌（E. coli）
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| 科學(xué)分類 | ||||
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變形菌門（Proteobacteria）是細(xì)菌中主要的一門，包括很多病原菌，如大腸桿菌、沙門氏菌、霍亂弧菌、幽門螺桿菌等著名的屬。[1]也有自由生活（非寄生）的種類，包括很多可以進(jìn)行固氮的細(xì)菌。
卡爾·烏斯于1987年建立這個(gè)群組，非正式的稱這是“紫細(xì)菌及其親屬”。[2]變形菌門主要是由核糖體RNA序列定義的，名稱取自希臘神話中能夠變形的神普羅透斯（這同時(shí)也是變形菌門中變形桿菌屬的名字），因?yàn)樵撻T細(xì)菌的形狀具有極為多樣的形狀。[3][4]
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特性
所有的變形菌門細(xì)菌為革蘭氏陰性菌，其外膜主要由脂多糖組成。很多種類利用鞭毛運(yùn)動(dòng)，但有一些非運(yùn)動(dòng)性的種類，或者依靠滑行來(lái)運(yùn)動(dòng)。此外還有一類獨(dú)特的粘細(xì)菌，可以聚集形成多細(xì)胞的子實(shí)體。變形菌門包含多種代謝種類。大多數(shù)細(xì)菌營(yíng)兼性或者專性厭氧及異養(yǎng)或者自養(yǎng)化能生物生活，但有很多例外。很多并非緊密相關(guān)的屬可以利用光合作用儲(chǔ)存能量。因其多數(shù)具有紫紅色的色素，被稱為紫細(xì)菌。
分類
變形菌門根據(jù)rRNA序列被分為五類（通常作為五個(gè)綱），用希臘字母α、β、γ、δ和ε命名。其中有的類別可能是并系的。
α-變形菌除包括光合的種類外，還有代謝C1化合物的種類、和植物共生的細(xì)菌（如根瘤菌屬）、與動(dòng)物共生的細(xì)菌和一類危險(xiǎn)的致病菌立克次體目。此外真核生物的線粒體的前身也很可能屬于這一類（參見(jiàn)內(nèi)共生學(xué)說(shuō)）。
β-變形菌包括很多好氧或兼性細(xì)菌，通常其降解能力可變，但也有一些無(wú)機(jī)化能種類（如可以氧化氨的亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas)）和光合種類（紅環(huán)菌屬(Rhodocyclus)和紅長(zhǎng)命菌屬(Rubrivivax)）。很多種類可以在環(huán)境樣品中發(fā)現(xiàn)，如廢水或土壤中。該綱的致病菌有奈氏球菌目(Neisseriales)的中一些細(xì)菌（可導(dǎo)致淋病和腦膜炎）和伯克氏菌屬(Burkholderia)。 在海洋中很少能發(fā)現(xiàn)β-變形菌。
γ-變形菌包括一些醫(yī)學(xué)上和科學(xué)研究中很重要的類群，如腸桿菌科(Enterobacteraceae)、弧菌科(Vibrionaceae)和假單胞菌科(Pseudomonadaceae)。很多重要的病原菌屬于這個(gè)綱，如沙門氏菌屬(Salmonella)（腸炎和傷寒）、耶爾辛氏菌屬(Yersinia)（鼠疫）、弧菌屬(Vibrio)（霍亂）、銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)（就醫(yī)時(shí)引發(fā)的肺部感染或者囊性纖維化）。重要的模式生物大腸桿菌也屬于此綱。
δ-變形菌包括基本好氧的形成子實(shí)體的粘細(xì)菌和嚴(yán)格厭氧的一些種類，如硫酸鹽還原菌（脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、脫硫菌屬(Desulfobacter)、脫硫球菌屬(Desulfococcus)、脫硫線菌屬(Desulfonema)等）和硫還原菌（如除硫單胞菌屬(Desulfuromonas)），以及具有其它生理特征的厭氧細(xì)菌，如還原三價(jià)鐵的地桿菌屬(Geobacter)和共生的暗桿菌屬(Pelobacter)和互營(yíng)菌屬(Syntrophus)。
ε-變形菌只有少數(shù)幾個(gè)屬，多數(shù)是彎曲或螺旋形的細(xì)菌，如沃林氏菌屬(Wolinella)、螺桿菌屬(Helicobacter)和彎曲菌屬(Campylobacter)。它們都生活在動(dòng)物或人的消化道中，為共生菌（沃林氏菌在牛中）或致病菌（螺桿菌在胃中或彎曲菌在十二指腸中）。
參見(jiàn)
參考文獻(xiàn)
- ↑ Madigan, M. and J. Martinko. (eds.). Brock Biology of Microorganisms. 11th. Prentice Hall. 2005. ISBN 0-13-144329-1.
- ↑ Woese, CR. [http//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC373105/ Bacterial evolution]. Microbiological reviews. 1987, 51 (2): 221–71. PMID 2439888. PMC 373105.
- ↑ Stackebrandt, E.; Murray, R. G. E.; Truper, H. G.. Proteobacteria classis nov., a Name for the Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives". International Journal of Systematic Bacteriology. 1988, 38 (3): 321. doi:10.1099/00207713-38-3-321.
- ↑ Proteobacteria. Discover Life: Tree of Life [2007-02-09].
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參考來(lái)源
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