生物分類法
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| 生物分類學 |
|---|
| 分類單元 |
| 域 | 界 | 門 | 綱 目 | 科 | 屬 | 種 |
| 二名法 |
| 三域系統 |
| 非細胞生物 |
| 細胞生物 |
生物分類法，又稱科學分類法，是生物學用來對生物的物種歸類的辦法。現代生物分類法源于林奈的系統，他根據物種共有的生理特征分類。在林奈之后，根據達爾文關于共同祖先的原則，此系統被逐漸改進。近年來，分子系統學應用了生物信息學方法分析基因組DNA，正在大幅改動很多原有的分類。生物分類法屬于分類學以及生物系統學。
目錄 |
現代發展
盡管林奈當時對生物分類只是為了方便鑒別，現在人們已經廣泛贊同分類應反映出達爾文關于共同祖先的原則。
隨著1960年代支序分類（cladistics）或稱分支學說（cladism）的出現，一個分類單元被定位在演化樹的某個位置。如果一個分類單元包括且僅包括某一個共同祖先的所有后代，稱其為單系群（monophyly）；相對應的，若該單元包括其共同祖先，但未包括其所有后代，則稱之為并系群（paraphyly）；若該分類不包括其最近共同祖先，則稱之為復系群（polyphyly）。根據分支學說，一個自然分類應該是單系群而非并系或復系。
目前正在計劃一種新的命名法，稱做PhyloCode，用來處理演化支（clade）而非分類單元（拉丁文taxon，復數taxa）。現在仍不清楚，這種新的命名法能否和其它的命名法則并存。
比較新的分類法中，域或稱總界是最高的單元。三域系統最初被創立于1990年，此后逐漸被學界承認。目前，大多數學者已經接受了此系統，但仍有一些學者遵循五界系統。三域系統的基本特征是將原本在細菌界（或稱原核生物界(Monera)）中的古細菌和真細菌獨立成細菌域(Bacteria)和古菌域(Archaea)。還有一些學者將古細菌列為第六個界但不接受三域系統。
個別科學家以“王國(界)之上是帝國”，借用政治和歷史上的概念，創立“帝國”的最大分類單位，把所有生物細胞有無核，分為真核生物和原核生物兩帝國。
早期分類系統
最早已知的對生命形式的分類系統由希臘哲學家亞里士多德所建立。他將動物根據運動方式（空中，陸上或水中）分類。1172年塞維利亞的法官伊本·路世德（ibn Rushd，即阿維羅伊Averroes）將亞里士多德的《論靈魂》（拉丁文de Anima）翻譯成阿拉伯文并刪節。其原始注解已佚，但由斯考特（Michael Scot）翻譯的拉丁文版本仍流傳。
在中國，明代李時珍（約1518–1593）在藥典《本草綱目》中，將生物藥材分為草部、谷部、菜部、果部、木部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部和人部。瑞士教授康拉德·馮·蓋斯納（Conrad von Gesner, 1516–1565）將當時已知的生物進行了分析性的歸納。
新大陸的發現為歐洲帶來了很多新奇的動物種類的描述和標本。在16世紀晚期和17世紀早期，人們開始對動物進行了詳細描述，先是人們熟悉的種類，隨后逐漸擴展，直到形成了基于解剖學基礎的足夠大的知識體系。這些解剖學知識主要來源于醫學解剖學家，隨后昆蟲學家和最初的顯微鏡學者將分類的范圍進一步擴大。
林奈氏分類法
卡爾·林奈（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《自然系統》（拉丁文Systema Naturae）在其一生中被改編過12次（1735年第一版）。在此書中，自然界被劃分為三個界：礦物、植物和動物。林奈用了四個分類等級：綱、目、屬和種。
林奈所建立了用于命名所有物種的學名的方法，并沿用至今。在林奈之前，命名一個物種需要很長的包括許多單詞的名稱，其中包括了對物種的描述，并且這些名稱不固定。林奈將物種名稱統一成兩個單詞的拉丁文名稱，即學名，由此分開了命名法和分類法。這種生物命名的方法稱作雙名法，具體命名辦法和書寫規則參見雙名法條目。
目前，命名法由命名法規（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等級的分類單元的名稱。
盡管在漢語中，各物種及分類單元有對應的漢語名稱，但在學術上為了方便交流和避免一物多名或一名多物的問題發生，所有國家仍通用拉丁語的命名法，物種的學名也專指雙名法的名稱。拉丁語的好處在于，它基本已經是一種“死”的語言，不再用作口語，因此相對穩定。
舉例
常見的五種細胞生物（果蠅、人、豌豆、釀酒酵母和大腸桿菌）的名稱和分類如下：
| 菌綠素種類 | 光合細菌 | 最大吸收峰(nm) | 乙醇中最大吸收峰(nm) | 作用 |
|---|---|---|---|---|
| 菌綠素a (BChl a) | 紫細菌、綠硫細菌和綠非硫細菌 | 800-810, 850-890 | 364, 770 | 反應中心或天線 |
| 菌綠素b (BChl b) | 紫細菌 | 1015-1035 | 373, 795 | 反應中心或天線 |
| 菌綠素c (BChl c) | 綠硫細菌和綠非硫細菌 | 745-760 | 434, 666 | 天線 |
| 菌綠素d (BChl d) | 綠硫細菌 | 725-745 | 427, 655 | 天線 |
| 菌綠素e (BChl e) | 綠硫細菌 | 715-725 | 469, 654 | 天線 |
| 菌綠素g (BChl g) | 太陽桿菌 | 770-790 | 反應中心 |
注：
- 表中很多分類尚有分歧，除細菌參照伯杰氏手冊[-{zh:失效連結;zh-tw:失效連結;zh-cn:失效鏈接}-]的分類大綱外，其余按照傳統分類，未有統一標準，謹作參考。
- 植物學和微生物學家用系統方法對較高級的分類單元命名，即用拉丁文中模式屬（type genus）屬名的詞干加上標準的詞尾來命名這個單元（見下表）。例如，薔薇科的“科長”（即模式屬）是薔薇屬(Rosa)，其詞干為“Ros-”，則薔薇科的拉丁名即為“Ros-”加上植物的科的后綴“-aceae”成為“Rosaceae”。中文的大多數分類單元也是類似用法，但：
- 動物學家通常只將類似命名法命名至科（包括總科）這一級，以上則多用描述法。
分類級別
- 為了更細致的分類，學者們在門、綱、目、科、屬、種之外加了很多附屬級別。最常用的是“亞-”(sub-)，在正常級別之下，如“亞綱”、“亞科”等等。在正常級別之上則為“總-”(super-)，如“總目”。比“亞”更小的還有“下-”，或譯作“次-”(infra-)。但下目仍然要比總科大。此外，對于植物，在科和屬之間還有“族”(拉tribus, tribi，英tribe)，屬之下還有“-{zh-cn:組; zh-tw:節;}-”(拉sectio, sectiones，英section)，再往下還能有“系”(拉、英series, series)。比較完整的種之上的分類單元的次序為（盡管目前大概沒有能把這些等級都用全的分類系統）：
-
- 域(總界) - 界 - 門 - 亞門 - 總綱 - 綱 - 亞綱 - 下綱 - 總目 - 目 - 亞目 - 下目 - 總科 - 科 - 亞科 - 族 - 亞族 - 屬 - 亞屬 - -{zh-cn:組; zh-tw:節;}- - 亞-{zh-cn:組; zh-tw:節;}- - 系 - 亞系 - 種
- 在種之下，動植物還能分成“亞種”(subspecies，簡寫subsp.)和“變種”(拉varietas, varietates，英variety，簡寫var.)，植物還能加上栽培種名。比如現代智人的學名為Homo sapiens subsp. sapiens，或者也可以直接省掉亞種簡寫直接寫成Homo sapiens sapiens。一種豌豆的變種的栽培種可寫成Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'。對于細菌和古菌，在種之下則用“株”(英strain)，如一株可以引起食物中毒的大腸桿菌菌株Escherichia coli O157:H7。注意只有屬之下的單位（包括亞種、變種）名用斜體，而屬級之上的單位、級別縮寫、栽培種名和菌株名用正體。
- 病毒與朊毒體(Prion)尚未有明確的分類。
- 注意：中文中任何分類單元均不使用斜體。
動物的分類級別
- 界 Kingdom Animalia
- 亞界 Subkingdom
- 支 Branch
- 下界 Infrakingdom
- 支 Branch
- 亞界 Subkingdom
- 總門 Superphylum
- 門 Phylum
- 亞門 Subphylum
- 下門 Infraphylum
- 小門 Microphylum
- 下門 Infraphylum
- 亞門 Subphylum
- 門 Phylum
- 總綱 Superclass
- 綱 Class
- 亞綱 Subclass
- 下綱 Infraclass
- 小綱 Parvclass
- 下綱 Infraclass
- 亞綱 Subclass
- 綱 Class
- 總部 Superlegion
- 部 Legion
- 亞部 Sublegion
- 下部 Infralegion
- 亞部 Sublegion
- 部 Legion
- 總群 Supercohort
- 群 Cohor
- 亞群 Subcohort
- 下群 Infracohort
- 亞群 Subcohort
- 群 Cohor
- 宏目 Gigaorder
- 高目 Magnorder or Megaorder
- 大目 Grandorder or Capaxorder
- 上目 Mirorder or Hyperorder
- 總目 Superorder
- 系 Series (for fishes)
- 目 Order
- 從目 Nanorder
- 次目 Hypoorder
- 若目 Minorder
- 亞目 Suborder
- 下目 Infraorder
- 小目 Parvorder or Microorder
- 下目 Infraorder
- 亞目 Suborder
- 若目 Minorder
- 次目 Hypoorder
- 從目 Nanorder
- 目 Order
- 系 Series (for fishes)
- 總目 Superorder
- 上目 Mirorder or Hyperorder
- 大目 Grandorder or Capaxorder
- 高目 Magnorder or Megaorder
- 宏科 Gigafamily
- 高科 Megafamily
- 大科 Grandfamily
- 上科 Hyperfamily
- 總科 Superfamily
- 領科 Epifamily
- 系 Series (for Lepidoptera)
- 組 Group (for Lepidoptera)
- 科 Family
- 亞科 Subfamily
- 下科 Infrafamily
- 亞科 Subfamily
- 科 Family
- 組 Group (for Lepidoptera)
- 系 Series (for Lepidoptera)
- 領科 Epifamily
- 總科 Superfamily
- 上科 Hyperfamily
- 大科 Grandfamily
- 高科 Megafamily
- 總族 Supertribe
- 族 Tribe
- 亞族 Subtribe
- 下族 Infratribe
- 亞族 Subtribe
- 族 Tribe
- 屬 Genus
- 亞屬 Subgenus
- 下屬 Infraspecific
- 亞屬 Subgenus
- 節 Section
- 亞節 Subsection
- 種團 Superspecies or Species-group
- 種 Species
- 亞種 Subspecies
- 型 Form/Morph
- 亞種 Subspecies
- 種 Species
以下的分類級別可用于綱之下、目之下、或科之下。常見于恐龍的分類。
- Superdivision
- Division
- Subdivision
- Infradivision
- Subdivision
- Division
屬以上級別學名之后綴
在屬以上級別的分類單元的學名通常由模式屬的詞干加上一個標準的后綴所構成。后綴的選擇取決于分類單元傳統上所在的大類別，如下表所示：
| 分類單元 | 植物 | 藻類 | 真菌 | 原核生物 | 動物 |
|---|---|---|---|---|---|
| 門 | -phyta | -phyta | -mycota | ||
| 亞門 | -phytina | -phytina | -mycotina | ||
| 綱 | -opsida | -phyceae | -mycetes | ||
| 亞綱 | -idae | -phycidae | -mycetidae | ||
| 總目 | -anae | ||||
| 目 | -ales | ||||
| 亞目 | -ineae | ||||
| 下目 | -aria | ||||
| 總科 | -acea | -oidea | |||
| 科 | -aceae | -idae | |||
| 亞科 | -oideae | -inae | |||
| 族 | -eae | -ini | |||
| 亞族 | -inae | -ina | |||
注意：
- 拉丁文的詞干可能并不能從主格的詞直接推斷出來，比如Homo（人屬）的詞根為homin-，而非hom-，因此人科不是Homidae而是Hominidae。
- 對于動物，標準的詞尾只上推到總目（《國際動物命名法規》(ICZN)中的27.2）。
- 對于原核生物，標準詞尾上推到目（目前總目等級沒有應用），詞尾同植物、藻類、真菌。
參見
- 生物分類學
- 雙名法
- 三名法
- 林奈氏分類系統
- 國際植物命名法規（自2012年已更名作：《國際藻類、真菌、植物命名法規》）
- 國際動物命名法規
- 國際細菌命名法規
- 國際病毒命名和分類法規
- 生物分類總表
- 系統發生樹
- 種系發生
外部鏈接
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參考來源
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